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林学院杨克强课题组发表梣属树种泛基因组并解析其盐胁迫适应机制-凯发k8真人版网址

作者:杨克强记者:通讯员:摄影: 出处:林学院 图书馆发布时间:2024-10-02

近日,plant communications在线发表了林学院杨克强教授课题组题为pan-genome analyses of eleven fraxinusspecies provide insights into salt adaptation in ash trees的研究论文,利用泛基因组分析了梣属树种进化适应性,挖掘了耐盐相关基因,解析了其耐盐机制。

梣属(fraxinus)包括40多个落叶乔木或灌木树种,广泛分布于北半球的暖温带和亚热带地区。梣属树种具有丰富的遗传多样性和广泛的生态环境适应性,如原产于北美洲的绒毛梣(f.velutina)和美国白梣(f. americana)引种到中国后,作为重要的耐盐树种用于盐碱地造林和景观绿化。杨克强教授团队测序、组装和注释了11个梣属树种染色体水平级的全基因组序列,构建了梣属物种的泛基因组图谱,全面分析了梣属物种的系统进化和耐盐适应性;利用种间杂交f1群体,构建了基于存在-缺失变异(presence-absence variation)的pav遗传连锁图谱,定位了2个与耐盐性显著相关的pav-qtl位点q6-45.2和q8-61.8,从中分别鉴定出了fvbhlh85和fvsweet5耐盐基因;基因功能分析表明,fvbhlh85基因介导了na /k 平衡和ros稳态,fvsweet5基因促进了可溶性糖的积累,进而增强了植株的耐盐性。研究结果丰富了梣属物种基因组数据,加深了对梣属物种进化适应性的理解,挖掘分析了耐盐基因的功能,为梣属树种基因组学研究和耐盐遗传改良奠定了基础。

图1 梣属树种泛基因组及耐盐性相关pav-qtl定位和耐盐基因挖掘


山东农业大学林学院青年教师刘建宁博士为论文第一作者,山东农业大学林学院杨克强教授、房鸿成副教授和山东省林业科学研究院吴德军研究员为论文通讯作者。山东农业大学林学院梁强博士和山东省林业科学研究院燕丽萍博士参与了本研究工作。该研究得到了山东省农业良种工程项目的资助。

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编      辑:万    千 

审      核:贾    波 

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